Friedrich M. Welz hat sein Leben lang nicht nur für die Galerie eingekauft und Ausstellungen veranstaltet, sondern auch eine persönliche Sammlung aufgebaut.
Mit Schenkung seiner Sammlung, die das gesamte druckgraphische Werk von Oskar Kokoschka und das bildnerische Zeugnis wichtiger Künstler (Ende 19. Jh. bis in die 70er Jahre des 20. Jh.) umfasste, legte der Kunsthändler und Verleger Friedrich M. Welz 1977 den Grundstock für die „Moderne Galerie und Graphische Sammlung Rupertinum“ in Salzburg.